1. MBR hanya mendukung 4 partisi primer, GPT jauh lebih banyak sehingga dapat memiliki hingga 128 partisi primer.
2. Kapasitas penyimpanan MBR sangat terbatas, hanya 2TB. Sedangkan GPT bisa sampai 9,4 ZB (Zeta byte).
3. Dalam partisi MBR, jika kita ingin menggunakan lebih dari 4 partisi, kita harus mengorbankan satu partisi primer untuk memperluasnya, maka kita dapat membuat banyak partisi logis. Karena di GPT, kita tidak perlu melakukan semua itu.
4. Di MBR hanya sektor pertama yang menyimpan informasi tentang partisi dan sistem operasi, tetapi di GPT informasi dicadangkan lebih dari sekali, sehingga meminimalkan konsekuensi jika sektor pertama rusak.
5. MBR dapat digunakan oleh semua sistem operasi. Hanya Windows XP 64-bit dan sistem operasi Windows yang didukung yang dapat menjalankan GPT.
6. Untuk dukungan boot 32-bit di GPT, hanya Windows 8. Sementara sistem operasi lain seperti Windows 7, Vista, tidak mendukung boot 32-bit dari GPT, dalam format itu, harap hapus semua file.
